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数据采集管理图谱采集

  • 来源:本站原创
  • 时间:2020/10/22 14:25:07
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三维天地面向信息标准化与质量数据系列等领域开设的专业分享与研究专栏,特邀两位观察员“智鉴君”和“标致妹”,为您解读前沿技术和行业最新资讯。以诙谐易懂的形式深入浅出,带您走进LIMS/MDM相关技术的奇妙世界。

现在随着实验室规模的扩大,实验室设备越来越多,试验数据的读取和解析需要智能升级,目前检测实验室通过图谱采集和分析技术逐步实现了设备联机的数据智能化处理。

智能设备产生数据形成图谱,并保存在电脑的制定文件夹中,LIMS系统通过采集工作站进行抓取电脑中图谱文件(这里的图谱文件格式不限制,可以是PDF、Excel、CSV等文件格式),通过配置相应的技术参数,将图谱中特定数值抓取至LIMS系统中。提高了检测人员工作效率,减轻了实验室检验人员的工作量、避免了手工录入数据产生的延时性,不准确性。此过程主要分为两个模块:采集客户端、LIMS系统中数据采集管理模块。

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采集客户端

(一)采集客户端的相关配置:

目前三维天地提供的采集客户端程序无需安装,解压指定文件夹后即可使用。采集客户端解压后需要将服务器地址更新至客户端中,维护服务器地址。维护后双击打开采集客户端程序维护组织机构、采集路径以及仪器配置。

(二)数据采集管理模块相关配置:

本项目采用一台仪器对应一个采集脚本,所以没有采取使用一个共同脚本通过配置完成数据采集工作过程。在上传采集脚本文件后还需要在“仪器管理”中对相应仪器维护接口及对应脚本。

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采集准备

除仪器采集客户端、仪器采集脚本以及相应仪器接口,脚本选择外,还需要在eln方法管理-仪器数据源中维护仪器数据源,如下图

文件生成后存放:文件生成后需要实验室相关人员存放至指定文件夹中,文件夹路径可在采集客户端,采集路径中指定相应位置。

上传文件要求:因本项目图谱复杂,规则不易整理,因此文件读取配置通过代码控制,每台仪器对应不同的采集脚本、文件读取规则。所有图谱均采用批号+样品编号+项目名称作为唯一性标识读取。

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抓取数据和上传

文件上传至指定文件夹中,工作站根据脚本文件解析对应的图谱数据,采集成功后,将按照指定规则将数据上传至LIMS数据库中,并且在结果录入环节将采集数据以列表形式展现出来。如下图。系统中设置了手动匹配与自动匹配两种方式,客户可根据自身需求,选择对应方式,将图谱数据传入原始记录中。

图谱上传采集成功后,会自动将图谱的PDF文件上传至LIMS系统结果录入附件中保存,文件默认在原始记录中显示,如有特殊情况可在附件中取消显示。

参考脚本对应图谱:

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数据解析完成

主要是针对样品编号、采集开始点、采集结束点以及图谱中采集数据进行定位。数据解析上传后,会将谱图文件以附件形式关联到原始记录中,上传后可选择是否在原始记录中显示。

样品编号/检测项目编写地点:

采集开始/结束编写位置:通过采集数据列上下行确定采集范围。

采集数据编写位置:将采集范围拆分成数组性质,对数据内数据进行取数。

如下图,文件名称为对应批号内容,在附件中可选择是否展示图谱内容。

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本文编辑:佚名
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